Genostats

We develop software (R packages) and methods for genetic data analysis.

• Gaston is an R package for Genetic data analysis : data manipulation (quality control), computation of GRM, heritability estimates, association testing.

• Fantasio is an R package for homozygosity mapping with dense SNP data (beta version)

• Ravages is an R package for the analysis of rare variants (beta version)

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Hervé Perdry

Je suis maître de conférences à l’Université Paris-Sud (UFR de Médecine & Inserm CESP). Après m’être longtemps consacré à l’algèbre constructive, je me suis converti en 2006 à l’analyse de données génétiques. J’ai enseigné en PACES, en L1 et L3 biologie, et j’enseigne actuellement dans le Master de Santé Publique de l’Université Paris-Sud.

CV au format pdf

E-mail : [prenom].[nom]@u-psud.fr

Documents de cours

M1 de Santé Publique

• Modélisation (poly)

• Modélisation (diapos)

M2 Génétique et Biomarqueurs

• Statistiques

• Génétique des populations

• Logiciel R

• Stratification de population dans les études d’association (diapos)

• Analyses de liaison

• Introduction à la Génétique Quantitative (diapos)

DFGSM 3

• Introduction à l’épidémiologie génétique

L3 & Magistère de biologie

• Temps discret, temps continu (version de 2014)

Publications

Mémoires

• Héritabilité, de la régression vers la moyenne au modèle mixte (HDR, 2017)

• Aspects constructifs de la théorie des corps valués (thèse, 2001)

Articles sélectionnés (génétique)

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